Die Manukablüte besteht aus 5 großen, weißen oder rosaroten rundlichen Blütenblättern mit deutlich ausgeprägten Staubblättern. Die Blüten sitzen einzeln aber dicht verteilt über den ganzen Ast. Die Blütezeit in Neuseeland dauert nur 6 bis 12 Wochen zwischen September und März. Der Fruchtknoten färbt sich dann zu einer dunkelroten Samenkapsel, die viele 2-3mm große Samen enthält. Sie bleibt ca. ein Jahr stehen, bevor sie aufspringt und die leichten Samen durch den Wind verteilt werden. Der Nektar der Manukablüten enthält in variablen Mengen das Kohlenhydrat DHA, das während der Honigreife zu MGO umgewandelt wird.
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